Laurea in Bioinformatica
Biologia molecolare - LABORATORIO DI BIOINFORMATICA II (2011/2012)
| Codice insegnamento |
4S00800 |
| Crediti |
6 |
| Settore disciplinare |
BIO/10 - BIOCHIMICA
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| Lingua di erogazione |
Italiano |
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| Pagine collegate |
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L'insegnamento è organizzato come segue:
Orario lezioni
| I semestre |
| Attività |
Giorno |
Ora |
Tipo |
Luogo |
Note |
| Teoria |
lunedì |
14.30 - 16.30 |
lezione |
Aula B
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| Laboratorio |
giovedì |
8.30 - 11.30 |
laboratorio |
Laboratorio didattico Alfa
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Obiettivi formativi
Acquisizione degli strumenti bioinformatici per l'analisi, l'interpretazione e la predizione di dati biologici in proteomica, genomica, biochimica, biologia molecolare e strutturale.
Programma
Strumenti bioinformatici per l'analisi di fenomeni di evoluzione molecolare e filogenesi: Orologio molecolare, modelli di sostituzione, filogenesi molecolare, metodi per la costruzione degli alberi filogenetici (algoritmi di clustering, metodi che massimizzano funzione obiettiva).
Programmi per la predizione della struttura tridimensionale di una proteina: modelling comparativo, Fold recognition e Ab initio.
Predizione automatica di geni utilizzando i programmi di ultima generazione.
Validazione delle predizioni geniche utilizzando dati di espressione
genica.
Annotazione funzionale e geni ortologhi.
Microarray. Uso dei principali programmi e delle banche dati per elaborazione, archiviazione e recupero di informazioni da microarray.
Introduzione ai calcoli energetici delle proteine: MD simulations, docking ligando-proteina e docking proteina-proteina
Modalita d'esame
scritto
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